비엠에스 | WE DELIVER SCIENCE

HOME >

메일발송

STOmics Stereo-Seq
받는 분

받는 이메일은 필수 입력사항입니다.

보내는 분

보내는 분 이름은 필수 입력사항입니다.

보내는 분 이메일은 필수 입력사항입니다.

코멘트
레이어팝업 닫기
Genomics > Single cell multi-omics

STOmics Stereo-Seq

  • 제품이미지 0
  • 제품이미지 1
  • 제품이미지 0
  • 제품이미지 1
제품용도
단일 세포 수준의 공간 유전체 분석 기술
브랜드
MGI
개요
Stereo-Seq (SpaTial Enhanced Resolution Omics-Sequencing) 기술은 RNA 추출없이 in situ capturing 방식을 통해 공간 전사체 분석 즉, 조직 내 세포의 위치 정보와 조직 내 세포간의 상호작용 및 유전자 발현 정보를 동시에 분석할 수 있는 기술 입니다.
DNB (DNA Nanoball) 기술을 기반으로 하는 Stereo-Seq은 나노 스케일 해상도와 panoramic view, comprehensive 한 정보를 제공할 수 있어 공간 전사체 분석에 있어 새로운 기술을 연구원들에게 제공할 수 있습니다.

Related Information

제품자료
Brochure
비디오
Video

제품특징

High Resolution : High resolution with ultra-high accuracy

 

Stereo-seq 500nm의 나노 단위 해상도를 제공하여 단일 세포 식별 및 공간적 위치 정보를 제공합니다. 

  

 

 

Larger FOV : Centimeter-scale field of view 

 

Stereo-seq 의 표준 Chip 크기는 1cm*1cm이며, 최대 13cm*13cm까지 커스터마이징 하실 수 있습니다.

 


 

 

STOmics Validated Tissue List


수 백가지의 조직 유형에 대한 Validation data를 공유합니다. 샘플 정보, 실험 매개변수 및 테스트 결과를 포함한 참고 자료를 제공합니다(자세히 보기)



연구 및 활용

- 동일한 조직 슬라이드에서 단백질, 전사체 정보 및 조직 형태 연구

- 세포 특이성을 가진 새로운 바이오마커와 잠재적 약물 발견

- 종양 영역의 다양한 유전자 발현 프로파일링을 통해 종양 미세 환경 탐색

- 다양한 조건에서의 발현하는 특정 단백질 세포 출처 확인




Workflow


Sample preparation → Imaging → mRNA capture and cDNA synthesis → Library construction → sequencing → Cloud-based data analysis and visualization

 


 

 

Application Example


 

[Stereo-seq을 통해 전체 마우스 배아 및 성체 마우스 뇌 시각화]

 

STOmics-GeneExpression Chip은 공간 좌표를 포함하는 프로브가 패턴화 되어있습니다. 조직 섹션과 상호작용 하여 칩 내 프로브가 mRNA를 캡처하고, 별도의 추출 없이 현장에서 cDNA가 합성됩니다. 공간 좌표와 함께 cDNA를 시퀀싱하면 조직 섹션의 공간 전사체 프로파일을 재구성 할 수 있어 시각화 및 분석에 용이합니다.

위의 예시는 마우스 배아에서 발달 구조에 따른 유전자 발현 패턴을 센티미터 단위의 시야로 분석한 결과 입니다. A. E16.5 배아 섹션의 H&E 염색, B. 클러스터링 분석으로 E16.5 배아에서 다양한 해부학적 구조를 식별, C. E16.5 배아 섹션에서 다양한 발달 구조에 따른 유전자의 공간적 Heatmap.

 

 

Recent Publications



[Spatiotemporal Transcriptomic Atlas of Mouse Organogenesis using DNA Nanoball Patterned Array]  

→ 자세히 보기

 

 


 

[High-resolution spatiotemporal Transcriptomic Maps of Developing Drosophila Embryos and Larvae]

→ 자세히 보기


  


 

[Spatiotemporal Mapping Gene Expression Landscapes and Developmental Trajectories During Zebrafish Embryogenesis]

→ 자세히 보기





[Single-cell Stereo-seq Enables Cell Type-specific Spatial Transcriptome Characterization in Arabidopsis Leaves] 

→ 자세히 보기





[Spatiotemporal Transcriptome at Single-cell Resolution Reveals Key Radial Glial Cell Population in Axolotl Telencephalon Development and Regeneration] 

→ 자세히 보기




 

[Spatially-resolved Transcriptomics Analyses of Invasive Fronts in Solid Tumors]

→ 자세히 보기

 

 

 

 

 

 

 

 

제품사양

Resolution 500nm
Chip FOV 100mm * 100mm
Plex Whole Transcriptome
Recommended sequencing amount < 300-500M
Compatible sample types Fresh frozen, RIN >=7
Workflow Permeabilization workflow : ~4h / Trascriptomics workflow : ~1.5 days (Total ~1.5 – 2 days)
Product Spec Permeabilization set : 4 chip/slide * 2 (8 RXN/set)
Trascriptomics set : 1 chip/slide * 4 (4 RXN/set)
Ideal for small samples < 90mm * 90mm

주문정보

Cat No. 품명 규격 제조사 제품정보 수량 견적문의
211SP118 Stereo-seq Permeabilization Set for Chip-on-a-slide 1 MGI Stereo-seq Permeabilization Kit (8 RXN) / STOmics Accessory Kit (5 PC) / Stereo-seq Chip P Slide (1cm*1cm) (8EA) 수량증가수량감소 카트담기 카트담기
견적문의 견적문의
211ST114 Stereo-seq Transcriptomics Set for Chip-on-a-slide 1 MGI Stereo-seq Transcriptomics T Kit (4 RXN) / STOmics Accessory Kit (4 PC) / Stereo-seq Chip T Slide (1cm*1cm) (4EA) 수량증가수량감소 카트담기 카트담기
견적문의 견적문의
111KL114 Stereo-seq Library Preparation Kit 1 MGI 4 RXN 수량증가수량감소 카트담기 카트담기
견적문의 견적문의
전체선택
Stereo-seq Permeabilization Set for Chip-on-a-slide
Cat No.
211SP118
규격
1
제조사
MGI
제품정보
Stereo-seq Permeabilization Kit (8 RXN) / STOmics Accessory Kit (5 PC) / Stereo-seq Chip P Slide (1cm*1cm) (8EA)
수량
수량증가수량감소
Stereo-seq Transcriptomics Set for Chip-on-a-slide
Cat No.
211ST114
규격
1
제조사
MGI
제품정보
Stereo-seq Transcriptomics T Kit (4 RXN) / STOmics Accessory Kit (4 PC) / Stereo-seq Chip T Slide (1cm*1cm) (4EA)
수량
수량증가수량감소
Stereo-seq Library Preparation Kit
Cat No.
111KL114
규격
1
제조사
MGI
제품정보
4 RXN
수량
수량증가수량감소

관련제품

Cat No. 품명 규격 제조사 제품정보 수량 견적문의
900-000128-00 Genetic Sequencer DNBSEQ-T7RS 1 MGI NGS sequencer 수량증가수량감소 카트담기 카트담기
견적문의 견적문의
전체선택
Genetic Sequencer DNBSEQ-T7RS
Cat No.
900-000128-00
규격
1
제조사
MGI
제품정보
NGS sequencer
수량
수량증가수량감소

최근 본 제품