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Genomics > NGS Library Prep System

plexWell Library Preparation Kits

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제품용도
Workflow 최적화 및 built-in normalization으로 3시간 이내에 대량 샘플을 간편하고 빠르게 준비할 수 있는 library prep kit
브랜드
seqWell
개요
Transposase 기반의 index tagging 및 built-in normalization으로 대량 샘플을 간편하게 multiplex 할 수 있는 Illumina platform 기반의 Library Prep kit입니다.

Related Information

제품자료
Brochure
비디오
Video

제품특징


 


SIMPLE and FAST  

1,000개 이상의 대량 샘플을 간단하고 빠르게 준비 완료 (최대 2,304 샘플 풀링 가능)

- 단 3시간 만에 library 제작 완성

Figure 1. 기존의 방식과 대비하여 DNA normalization 및 library quantitation 단계의 생략으로 library 제작 소요 시간 단축



Figure 2. 초기 pooling 단계를 통해 적은 tube 사용으로 보다 간편한 workflow



Built-in Normalization 

seqWell만의 독자적인 기술로 built in-normalization 가능 

- 초기 샘플의 normalization 없이, 다양한 범위의 샘플 양으로부터 균일한 양의 library 제작이 가능

 

Figure 3. 기존의 multiplexing에서의 normalization 한계점을 해결한 plexWell 기술



PlexWell™ Library Prep Chemistry



 

Precision multiplexing  

seqWell만의 multiplexing 기술로 매우 균일한 insert size 및 samples read counts를 제공 


Figure 4. Left: input 양 대비, size 분포가 균일한 plexWell library, right: 평균 insert size가 균일한 96-plex library

  


Figure 5. European(A) 및 African Population(B)의 Low-pass WGS 분석 결과 및 Gold standard와의 SNP 일치도

seqWell low-pass WGS 결과와 gold standard 방식(microarray)의 genotyping 결과에서 SNP의 높은 일치도(약 99%)를 나타냄

 


Figure 6. (A) Histograms of 139 Rice RIL Summary Statistics of Coverage and Imputed Genotype Calls and (B) Concordance with Genotyping by Sequencing

Rice hybrid 139 샘플의 plexWell kit을 이용한 imputed WGS 데이터가 기존에 분석 완료된 GBS 시퀀싱 population (Fragoso et al. 2017)과 매우 일치하는 결과를 나타냄

  

 

plexWell technology 

 plexWell은 transposase를 이용한 순차적 tagging 방식의 독자적인 기술을 선보이고 있습니다.

이러한 방식은 다른 transposon 방식에 비해 workflow 단계에서의 bias와 input DNA 양에 따른 편차를 최소화합니다.


1. Sample barcoding 

 - DNA는 P7 primer와 i7 index를 포함한 sample barcode transposon에 의해 무작위로 tagging 됨

- 샘플 별 동일한 양의 sample barcode transposon 사용을 통해 normalization 과정 없이 pooling 진행

 


2. Pool barcoding 

- Pooling된 샘플들은 P5 adapter와 pool별 특정한 i5 index를 포함한 pooled barcode transposon에 의해 tagging됨 

- 충분한 양의 pooled barcode transposon으로 sample barcode로부터 일정한 거리에서 tagging됨

 

 

3. Amplified and final library 

- Universal primer를 이용하여 barcoded library 증폭 및 SPRI purification을 통해 최종 library 완성 

 



Applications 

Small and large whole genome 

- Microbial genomes

- Microbe screening

- Amplicons and plasmids

- Low-pass plant/animal/human

- BAC/Fosmid/Cosmids

- RNA-seq

제품사양

Sample Type Amplicons, Plasmids, Genomic DNA, cDNA
DNA Input Range PW096, PW384: 3 – 30 ng
LP384: 5-25 ng
Indexing Method CDI (combinatorial dual index)
Number of Index Combinations PW096: 96
PW384, LP384: 2,304 (96 x 24)
Paired Reads /Sample PW096, PW384: ≤ 4 million
LP384: ≤ 20 million
Reactions per Kit PW096: 96 rxn
PW384: 384 rxn (96 plates x 4)
※참고사항 본 제품은 throughput에 따라 3가지 모델로 제공됩니다.
PW384: plexWell ™ 384
PW096: plexWell ™ 96
LP384: plexWell™ LP 384

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LP384 plexWell™ LP 384 Library Preparation Kit (low-pass whole genome) 384 rxn seqWell Library prep kit 수량증가수량감소 카트담기 카트담기
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ExpressPlex™ 2.0 384 Library Prep Kit, EA
Cat No.
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384 rxn
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