SIMPLE and FAST
- 1,000개 이상의 대량 샘플을 간단하고 빠르게 준비 완료 (최대 2,304 샘플 풀링 가능)
- 단 3시간 만에 library 제작 완성
Figure 2. 초기 pooling 단계를 통해 적은 tube 사용으로 보다 간편한 workflow
Built-in Normalization
- seqWell만의 독자적인 기술로 built in-normalization 가능
- 초기 샘플의 normalization 없이, 다양한 범위의 샘플 양으로부터 균일한 양의 library 제작이 가능
Figure 3. 기존의 multiplexing에서의 normalization 한계점을 해결한 plexWell 기술
PlexWell™ Library Prep Chemistry
Precision multiplexing
- seqWell만의 multiplexing 기술로 매우 균일한 insert size 및 samples read counts를 제공
Figure 4. Left: input 양 대비, size 분포가 균일한 plexWell library, right: 평균 insert size가 균일한 96-plex library
Figure 5. European(A) 및 African Population(B)의 Low-pass WGS 분석 결과 및 Gold standard와의 SNP 일치도
seqWell low-pass WGS 결과와 gold standard 방식(microarray)의 genotyping 결과에서 SNP의 높은 일치도(약 99%)를 나타냄
Figure 6. (A) Histograms of 139 Rice RIL Summary Statistics of Coverage and Imputed Genotype Calls and (B) Concordance with Genotyping by Sequencing
Rice hybrid 139 샘플의 plexWell kit을 이용한 imputed WGS 데이터가 기존에 분석 완료된 GBS 시퀀싱 population (Fragoso et al. 2017)과 매우 일치하는 결과를 나타냄
plexWell technology
plexWell은 transposase를 이용한 순차적 tagging 방식의 독자적인 기술을 선보이고 있습니다.
이러한 방식은 다른 transposon 방식에 비해 workflow 단계에서의 bias와 input DNA 양에 따른 편차를 최소화합니다.
1. Sample barcoding
- DNA는 P7 primer와 i7 index를 포함한 sample barcode transposon에 의해 무작위로 tagging 됨
- 샘플 별 동일한 양의 sample barcode transposon 사용을 통해 normalization 과정 없이 pooling 진행
- Pooling된 샘플들은 P5 adapter와 pool별 특정한 i5 index를 포함한 pooled barcode transposon에 의해 tagging됨
- 충분한 양의 pooled barcode transposon으로 sample barcode로부터 일정한 거리에서 tagging됨
3. Amplified and final library
- Universal primer를 이용하여 barcoded library 증폭 및 SPRI purification을 통해 최종 library 완성
Applications
- Small and large whole genome
- Microbial genomes
- Microbe screening
- Amplicons and plasmids
- Low-pass plant/animal/human
- BAC/Fosmid/Cosmids
- RNA-seq
Sample Type | Amplicons, Plasmids, Genomic DNA, cDNA |
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DNA Input Range | PW096, PW384: 3 – 30 ng LP384: 5-25 ng |
Indexing Method | CDI (combinatorial dual index) |
Number of Index Combinations | PW096: 96 PW384, LP384: 2,304 (96 x 24) |
Paired Reads /Sample | PW096, PW384: ≤ 4 million LP384: ≤ 20 million |
Reactions per Kit | PW096: 96 rxn PW384: 384 rxn (96 plates x 4) |
※참고사항 | 본 제품은 throughput에 따라 3가지 모델로 제공됩니다. PW384: plexWell ™ 384 PW096: plexWell ™ 96 LP384: plexWell™ LP 384 |
Cat No. | 품명 | 규격 | 제조사 | 제품정보 | 수량 | 견적문의 | |
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LP384 | plexWell™ LP 384 Library Preparation Kit (low-pass whole genome) | 384 rxn | seqWell | Library prep kit | 카트담기 견적문의 |
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PW096 | plexWell™ 96 Library Preparation Kit | 96 rxn | seqWell | Library prep kit | 카트담기 견적문의 |
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PW384 | plexWell™ 384 Library Preparation Kit | 384 rxn | seqWell | Library prep kit | 카트담기 견적문의 |
전체선택 | |
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plexWell™ LP 384 Library Preparation Kit (low-pass whole genome)
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plexWell™ 96 Library Preparation Kit
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plexWell™ 384 Library Preparation Kit
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Cat No. | 품명 | 규격 | 제조사 | 제품정보 | 수량 | 견적문의 | |
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301067 -301070 | purePlex™ DNA Library Preparation Kit | 96 rxn | seqWell | Library prep kit | 카트담기 견적문의 |
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301170 | ExpressPlex™ 2.0 96 Library Prep Kit, EA | 96 rxn | seqWell | Library prep kit | 카트담기 견적문의 |
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301176 - 301179 | ExpressPlex™ 2.0 384 Library Prep Kit, EA | 384 rxn | seqWell | Library prep kit | 카트담기 견적문의 |
전체선택 | |
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purePlex™ DNA Library Preparation Kit
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ExpressPlex™ 2.0 96 Library Prep Kit, EA
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ExpressPlex™ 2.0 384 Library Prep Kit, EA
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