Figure 2. 초기 pooling 단계를 통해 적은 tube 사용으로 보다 간편한 workflow

Built-in Normalization 

- seqWell만의 독자적인 기술로 built in-normalization 가능

- 초기 샘플의 normalization 없이, 다양한 범위의 샘플 양으로부터 균일한 양의 library 제작이 가능

Figure 3. 기존의 multiplexing에서의 normalization 한계점을 해결한 plexWell 기술

Precision multiplexing 

- seqWell만의 multiplexing 기술로 매우 균일한 insert size 및 samples read counts를 제공

Figure 4. Left: input 양 대비, size 분포가 균일한 plexWell library, right: 평균 insert size가 균일한 96-plex library

Figure 5. 다양한 GC content 샘플의 안정적인 Mutlplexing 효율 

그래프 A는 8개의 다른 미생물 gDNA(32% GC ~67% GC)의 read count를 나타낸 것으로 plexWell 라이브러리의 균일성이 다양한 샘플 유형에서도 유지된다는 것을 보여주고 있습니다. 각 샘플은 plexWell Plus24 kit를 사용하여 3배수로 준비한 뒤 시퀀싱 한 결과입니다. 그래프 B는 plexWell 라이브러리(녹색)와 Nextera XT(회색) 라이브러리의 샘플(E.coli)에 대한  coverage의 균일성을 GC%에 따라 보여주며, plexWell 라이브러리에서 더 넓은 범위의 GC%에 대한 coverage 균일성이 우수함을 보여줍니다. 

Figure 6. European(A) 및 African Population(B)의 Low-pass WGS 분석 결과 및 Gold standard와의 SNP 일치도

seqWell low-pass WGS 결과와 gold standard 방식(microarray)의 genotyping 결과에서 SNP의 높은 일치도(약 99%)를 나타냄

Figure 7. (A) Histograms of 139 Rice RIL Summary Statistics of Coverage and Imputed Genotype Calls and (B) Concordance with Genotyping by Sequencing

Rice hybrid 139 샘플의 plexWell kit을 이용한 imputed WGS 데이터가 기존에 분석 완료된 GBS 시퀀싱 population (Fragoso et al. 2017)과 매우 일치하는 결과를 나타냄

plexWell technology 

plexWell은 transposase를 이용한 순차적 tagging 방식의 독자적인 기술을 선보이고 있습니다.

이러한 방식은 다른 transposon 방식에 비해 workflow 단계에서의 bias와 input DNA 양에 따른 편차를 최소화합니다.

1. Sample barcoding 

- DNA는 P7 primer와 i7 index를 포함한 sample barcode transposon에 의해 무작위로 tagging 됨

- 샘플 별 동일한 양의 sample barcode transposon 사용을 통해 normalization 과정 없이 pooling 진행

Applications 

- Small and large whole genome

- Microbial genomes

- Microbe screening

- Amplicons and plasmids

- Low-pass plant/animal/human

- BAC/Fosmid/Cosmids

- RNA-seq

plexWell Kit Configurations for Every Scale