CoolMPS 원리
- Cold dNTPs(형광 표지 없는 dNTPs)와 형광 표지된 항체 세트로 구성
- 형광 표지 된 항체세트는 각 dNTP의 extension block에 특이적으로 결합함
- 결합되어 있는 항체의 형광을 CCD camera를 통해 읽음
- Regeneration 과정에서 항체와 extension block이 제거되면, 다음 dNTP가 결합함
약 3배 강화된 Signal
- 항체당 하나 이상의 형광이 표지됨으로써, Target signal 및 SNR(signal to noise ratio)증가
감소된 오차율
- 형광 표지된 dNTPs 사용 시 발생할 수 있는 scar 현상을 최소화
* scar 현상이란?
: 형광이 cleavage 되면서 dNTP에 약 10개 원자가 남아 signal에 영향을 주는 현상
Polymerase reaction 정확도 증가
- 원형의 dNTP를 사용함으로써 형광 표지 dNTP 시스템 대비
높은 DNA polymerase reatcion 효율 확보
* Runon: 각 cycle당 두개 또는 그 이상의 염기가 합성되는 경우
* Lag: 각 cycle당 염기가 합성되지 않는 경우
Applications
- 다양한 어플리케이션에서 시퀀싱 효율 개선
: WGS(PCR), WGS(PCR free), WES, RNASEQ, panal, NIPT, CNV
- Q30 90% 이상의 고품질 데이터 제공: 기존 방식 대비 Output 6%, Q30값 1~9% 증가
RNAseq perfomance
- UUHR library, MGIEasy RNA directional prep kit 이용
Mutation Frequency Detection In Tumor Panel
- FFPE standard (Horizon, HD200), MGI ATOPlex panel 이용
Flow cell | FCL |
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Max. cycles | 70(SE50), 120(SE100), 220(PE100) |
Effective reads/flow cell | 1500~2000M(SE50), 1500~2000M(SE100), 1500~2000M(PE100) |
Data output/flow cell | 75~100G(SE50), 150~200G(SE100), 300~400G(PE100) |
Q30 | >90% |
Run time | ~17h(SE50), ~30h(SE100), ~58h(PE100) |
Cat No. | 품명 | 규격 | 제조사 | 제품정보 | 수량 | 견적문의 | |
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1000017992 | CoolMPS High-throughput Sequencing Set (DNBSEQ-G400RS FCL SE50) | 1ea | MGI | Sequencing kit | 카트담기 견적문의 |
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1000016933 | CoolMPS High-throughput Sequencing (DNBSEQ-G400RS FCL SE100) | 1ea | MGI | Sequencing kit | 카트담기 견적문의 |
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1000016935 | CoolMPS High-throughput Sequencing (DNBSEQ-G400RS FCL PE100) | 1ea | MGI | Sequencing kit | 카트담기 견적문의 |
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1000019478 | CoolMPS High-throughput Sequencing (DNBSEQ-G400RS Small RNA FCL SE50) | 1ea | MGI | Sequencing kit | 카트담기 견적문의 |
전체선택 | |
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CoolMPS High-throughput Sequencing Set (DNBSEQ-G400RS FCL SE50)
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CoolMPS High-throughput Sequencing (DNBSEQ-G400RS FCL SE100)
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CoolMPS High-throughput Sequencing (DNBSEQ-G400RS FCL PE100)
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CoolMPS High-throughput Sequencing (DNBSEQ-G400RS Small RNA FCL SE50)
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