High Resolution : High resolution with ultra-high accuracy
- Stereo-seq 은 500nm의 나노 단위 해상도를 제공하여 단일 세포 식별 및 공간적 위치 정보를 제공합니다.
Larger
FOV : Centimeter-scale field of view
- Stereo-seq 의 표준 Chip 크기는 1cm*1cm이며, 최대 13cm*13cm까지 커스터마이징 하실 수 있습니다.
STOmics Validated Tissue List
- 수 백가지의 조직 유형에 대한 Validation data를 공유합니다. 샘플 정보, 실험 매개변수 및 테스트 결과를 포함한 참고 자료를 제공합니다. (자세히 보기)
연구 및 활용
- 동일한 조직 슬라이드에서 단백질, 전사체 정보 및 조직 형태 연구
- 세포 특이성을 가진 새로운 바이오마커와 잠재적 약물 발견
- 종양 영역의 다양한 유전자 발현 프로파일링을 통해 종양 미세 환경 탐색
- 다양한 조건에서의 발현하는 특정 단백질 세포 출처 확인
Workflow
Sample preparation → Imaging → mRNA capture and cDNA synthesis → Library construction → sequencing → Cloud-based data analysis and visualization
Application
Example
[Stereo-seq을 통해 전체 마우스 배아 및 성체 마우스 뇌 시각화]
STOmics-GeneExpression Chip은 공간 좌표를 포함하는 프로브가 패턴화 되어있습니다. 조직 섹션과 상호작용 하여 칩 내 프로브가 mRNA를 캡처하고, 별도의 추출 없이 현장에서 cDNA가 합성됩니다. 공간 좌표와 함께 cDNA를 시퀀싱하면 조직 섹션의 공간 전사체 프로파일을 재구성 할 수 있어 시각화 및 분석에 용이합니다.
위의 예시는 마우스 배아에서 발달 구조에 따른 유전자 발현 패턴을 센티미터 단위의 시야로 분석한 결과 입니다. A. E16.5 배아 섹션의 H&E 염색, B. 클러스터링 분석으로 E16.5 배아에서 다양한 해부학적 구조를 식별, C. E16.5 배아 섹션에서 다양한 발달 구조에 따른 유전자의 공간적 Heatmap.
Recent Publications
[Spatiotemporal Transcriptomic Atlas of Mouse Organogenesis using DNA Nanoball Patterned Array]
[High-resolution spatiotemporal
Transcriptomic Maps of Developing Drosophila Embryos and Larvae]
[Spatiotemporal Mapping Gene Expression Landscapes and Developmental Trajectories During Zebrafish Embryogenesis]
[Single-cell Stereo-seq Enables Cell Type-specific Spatial Transcriptome Characterization in Arabidopsis Leaves]
[Spatiotemporal Transcriptome at Single-cell Resolution Reveals Key Radial Glial Cell Population in Axolotl Telencephalon Development and Regeneration]
[Spatially-resolved
Transcriptomics Analyses of Invasive Fronts in Solid Tumors]
| Resolution | 500nm |
|---|---|
| Chip FOV | 100mm * 100mm |
| Plex | Whole Transcriptome |
| Recommended sequencing amount | < 300-500M |
| Compatible sample types | Fresh frozen, RIN >=7 |
| Workflow | Permeabilization workflow : ~4h / Trascriptomics workflow : ~1.5 days (Total ~1.5 – 2 days) |
| Product Spec | Permeabilization set : 4 chip/slide * 2 (8 RXN/set) |
| Trascriptomics set : 1 chip/slide * 4 (4 RXN/set) | |
| Ideal for small samples | < 90mm * 90mm |
| Cat No. | 품명 | 규격 | 제조사 | 제품정보 | 수량 | 견적문의 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 211SP118 | Stereo-seq Permeabilization Set for Chip-on-a-slide | 1 | BGI | Stereo-seq Permeabilization Kit (8 RXN) / STOmics Accessory Kit (5 PC) / Stereo-seq Chip P Slide (1cm*1cm) (8EA) |   |
 카트담기 견적문의 |
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| 211ST114 | Stereo-seq Transcriptomics Set for Chip-on-a-slide | 1 | BGI | Stereo-seq Transcriptomics T Kit (4 RXN) / STOmics Accessory Kit (4 PC) / Stereo-seq Chip T Slide (1cm*1cm) (4EA) | |
카트담기 견적문의 |
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| 111KL114 | Stereo-seq Library Preparation Kit | 1 | BGI | 4 RXN | |
카트담기 견적문의 |
| 전체선택 | |
|---|---|
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Stereo-seq Permeabilization Set for Chip-on-a-slide
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Stereo-seq Transcriptomics Set for Chip-on-a-slide
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Stereo-seq Library Preparation Kit
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